Protein–RNA interactions for Protein: Q3URI6

Zfp560, Zinc finger protein 560, mousemouse

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp560Q3URI6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms