Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR50

Vwa5b2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5b2Q3UR50 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vwa5b2Q3UR50 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vwa5b2Q3UR50 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vwa5b2Q3UR50 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vwa5b2Q3UR50 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vwa5b2Q3UR50 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vwa5b2Q3UR50 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vwa5b2Q3UR50 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vwa5b2Q3UR50 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vwa5b2Q3UR50 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vwa5b2Q3UR50 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vwa5b2Q3UR50 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vwa5b2Q3UR50 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vwa5b2Q3UR50 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vwa5b2Q3UR50 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vwa5b2Q3UR50 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vwa5b2Q3UR50 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vwa5b2Q3UR50 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vwa5b2Q3UR50 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vwa5b2Q3UR50 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vwa5b2Q3UR50 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vwa5b2Q3UR50 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vwa5b2Q3UR50 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vwa5b2Q3UR50 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vwa5b2Q3UR50 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vwa5b2Q3UR50 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vwa5b2Q3UR50 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vwa5b2Q3UR50 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms