Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQS8

Rbm20, RNA-binding protein 20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm20Q3UQS8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbm20Q3UQS8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbm20Q3UQS8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbm20Q3UQS8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbm20Q3UQS8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbm20Q3UQS8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbm20Q3UQS8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbm20Q3UQS8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbm20Q3UQS8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbm20Q3UQS8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbm20Q3UQS8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbm20Q3UQS8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbm20Q3UQS8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbm20Q3UQS8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbm20Q3UQS8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbm20Q3UQS8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbm20Q3UQS8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbm20Q3UQS8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbm20Q3UQS8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbm20Q3UQS8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rbm20Q3UQS8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rbm20Q3UQS8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rbm20Q3UQS8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rbm20Q3UQS8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbm20Q3UQS8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms