Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms