Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms