Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULP7

Ctsll3, Cathepsin L-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctsll3Q3ULP7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ctsll3Q3ULP7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ctsll3Q3ULP7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ctsll3Q3ULP7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ctsll3Q3ULP7 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ctsll3Q3ULP7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms