Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
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Usp19Q3UJD6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Usp19Q3UJD6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Usp19Q3UJD6 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Usp19Q3UJD6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Usp19Q3UJD6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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