Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Greb1Q3UHK3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms