Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip13Q3UA06 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms