Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LbrQ3U9G9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LbrQ3U9G9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LbrQ3U9G9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LbrQ3U9G9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LbrQ3U9G9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LbrQ3U9G9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LbrQ3U9G9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LbrQ3U9G9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LbrQ3U9G9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LbrQ3U9G9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LbrQ3U9G9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LbrQ3U9G9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LbrQ3U9G9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LbrQ3U9G9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms