Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms