Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtpbp6Q3U6U5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtpbp6Q3U6U5 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Gtpbp6Q3U6U5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Gtpbp6Q3U6U5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtpbp6Q3U6U5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Gtpbp6Q3U6U5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Gtpbp6Q3U6U5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Gtpbp6Q3U6U5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Gtpbp6Q3U6U5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Gtpbp6Q3U6U5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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Gtpbp6Q3U6U5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms