Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ulk3Q3U3Q1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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