Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Otud5Q3U2S4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Otud5Q3U2S4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Otud5Q3U2S4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Otud5Q3U2S4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Otud5Q3U2S4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Otud5Q3U2S4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Otud5Q3U2S4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Otud5Q3U2S4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Otud5Q3U2S4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Otud5Q3U2S4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Otud5Q3U2S4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Otud5Q3U2S4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Otud5Q3U2S4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Otud5Q3U2S4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Otud5Q3U2S4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms