Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms