Protein–RNA interactions for Protein: Q3U213

Serac1, Protein SERAC1, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serac1Q3U213 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Serac1Q3U213 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Serac1Q3U213 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Serac1Q3U213 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Serac1Q3U213 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Serac1Q3U213 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Serac1Q3U213 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Serac1Q3U213 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Serac1Q3U213 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Serac1Q3U213 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Serac1Q3U213 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Serac1Q3U213 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Serac1Q3U213 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Serac1Q3U213 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Serac1Q3U213 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Serac1Q3U213 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Serac1Q3U213 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Serac1Q3U213 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Serac1Q3U213 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Serac1Q3U213 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Serac1Q3U213 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Serac1Q3U213 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Serac1Q3U213 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Serac1Q3U213 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Serac1Q3U213 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms