Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Hace1Q3U0D9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms