Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc28Q3TX51 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms