Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TchpQ3TVW5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms