Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccdc136Q3TVA9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms