Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms