Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Calr4Q3TQS0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Calr4Q3TQS0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Calr4Q3TQS0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Calr4Q3TQS0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Calr4Q3TQS0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Calr4Q3TQS0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Calr4Q3TQS0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calr4Q3TQS0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calr4Q3TQS0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calr4Q3TQS0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calr4Q3TQS0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calr4Q3TQS0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calr4Q3TQS0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calr4Q3TQS0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calr4Q3TQS0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calr4Q3TQS0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Calr4Q3TQS0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Calr4Q3TQS0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Calr4Q3TQS0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calr4Q3TQS0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calr4Q3TQS0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calr4Q3TQS0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calr4Q3TQS0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calr4Q3TQS0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Calr4Q3TQS0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Calr4Q3TQS0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Calr4Q3TQS0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Calr4Q3TQS0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Calr4Q3TQS0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Calr4Q3TQS0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms