Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR3

Nlrp4c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4cQ3TKR3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nlrp4cQ3TKR3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nlrp4cQ3TKR3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nlrp4cQ3TKR3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp4cQ3TKR3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp4cQ3TKR3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp4cQ3TKR3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp4cQ3TKR3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp4cQ3TKR3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp4cQ3TKR3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp4cQ3TKR3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp4cQ3TKR3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp4cQ3TKR3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp4cQ3TKR3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp4cQ3TKR3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp4cQ3TKR3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp4cQ3TKR3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp4cQ3TKR3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp4cQ3TKR3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp4cQ3TKR3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp4cQ3TKR3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp4cQ3TKR3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp4cQ3TKR3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp4cQ3TKR3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp4cQ3TKR3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp4cQ3TKR3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp4cQ3TKR3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp4cQ3TKR3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp4cQ3TKR3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp4cQ3TKR3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp4cQ3TKR3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp4cQ3TKR3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp4cQ3TKR3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp4cQ3TKR3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp4cQ3TKR3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp4cQ3TKR3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp4cQ3TKR3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp4cQ3TKR3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms