Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms