Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms