Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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