Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam178bQ24JP3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam178bQ24JP3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam178bQ24JP3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam178bQ24JP3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam178bQ24JP3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam178bQ24JP3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam178bQ24JP3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam178bQ24JP3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam178bQ24JP3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam178bQ24JP3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam178bQ24JP3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam178bQ24JP3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam178bQ24JP3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam178bQ24JP3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam178bQ24JP3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam178bQ24JP3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam178bQ24JP3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam178bQ24JP3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam178bQ24JP3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam178bQ24JP3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam178bQ24JP3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam178bQ24JP3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam178bQ24JP3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam178bQ24JP3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam178bQ24JP3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam178bQ24JP3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam178bQ24JP3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam178bQ24JP3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam178bQ24JP3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam178bQ24JP3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam178bQ24JP3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam178bQ24JP3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam178bQ24JP3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam178bQ24JP3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam178bQ24JP3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam178bQ24JP3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam178bQ24JP3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam178bQ24JP3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam178bQ24JP3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam178bQ24JP3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam178bQ24JP3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam178bQ24JP3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam178bQ24JP3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam178bQ24JP3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam178bQ24JP3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam178bQ24JP3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam178bQ24JP3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam178bQ24JP3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam178bQ24JP3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam178bQ24JP3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam178bQ24JP3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam178bQ24JP3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam178bQ24JP3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam178bQ24JP3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam178bQ24JP3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam178bQ24JP3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam178bQ24JP3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam178bQ24JP3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam178bQ24JP3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam178bQ24JP3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam178bQ24JP3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam178bQ24JP3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam178bQ24JP3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam178bQ24JP3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam178bQ24JP3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam178bQ24JP3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam178bQ24JP3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam178bQ24JP3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam178bQ24JP3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam178bQ24JP3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam178bQ24JP3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam178bQ24JP3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam178bQ24JP3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam178bQ24JP3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam178bQ24JP3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fam178bQ24JP3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam178bQ24JP3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam178bQ24JP3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam178bQ24JP3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam178bQ24JP3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam178bQ24JP3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam178bQ24JP3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam178bQ24JP3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam178bQ24JP3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam178bQ24JP3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam178bQ24JP3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam178bQ24JP3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam178bQ24JP3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam178bQ24JP3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam178bQ24JP3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam178bQ24JP3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam178bQ24JP3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam178bQ24JP3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam178bQ24JP3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fam178bQ24JP3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam178bQ24JP3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam178bQ24JP3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam178bQ24JP3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fam178bQ24JP3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms