Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cers3Q1A3B0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cers3Q1A3B0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
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