Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptcd3Q14C51 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptcd3Q14C51 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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