Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Traf3ip1Q149C2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms