Protein–RNA interactions for Protein: Q148W8

Dusp27, Inactive dual specificity phosphatase 27, mousemouse

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Length 1,138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp27Q148W8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dusp27Q148W8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dusp27Q148W8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dusp27Q148W8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Dusp27Q148W8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dusp27Q148W8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dusp27Q148W8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dusp27Q148W8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dusp27Q148W8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dusp27Q148W8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dusp27Q148W8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dusp27Q148W8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dusp27Q148W8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dusp27Q148W8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dusp27Q148W8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Dusp27Q148W8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Dusp27Q148W8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Dusp27Q148W8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Dusp27Q148W8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Dusp27Q148W8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dusp27Q148W8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms