Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Spatc1Q148B6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Spatc1Q148B6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Spatc1Q148B6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Spatc1Q148B6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Spatc1Q148B6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Spatc1Q148B6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Spatc1Q148B6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Spatc1Q148B6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Spatc1Q148B6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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