Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gli2Q0VGT2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms