Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG18

Smim24, Small integral membrane protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim24Q0VG18 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim24Q0VG18 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim24Q0VG18 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim24Q0VG18 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim24Q0VG18 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim24Q0VG18 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim24Q0VG18 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim24Q0VG18 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim24Q0VG18 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim24Q0VG18 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim24Q0VG18 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim24Q0VG18 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim24Q0VG18 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim24Q0VG18 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim24Q0VG18 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim24Q0VG18 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim24Q0VG18 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim24Q0VG18 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim24Q0VG18 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim24Q0VG18 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim24Q0VG18 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim24Q0VG18 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim24Q0VG18 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim24Q0VG18 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim24Q0VG18 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim24Q0VG18 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim24Q0VG18 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim24Q0VG18 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim24Q0VG18 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim24Q0VG18 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim24Q0VG18 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim24Q0VG18 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim24Q0VG18 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim24Q0VG18 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim24Q0VG18 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim24Q0VG18 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms