Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atp2b3Q0VF55 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Atp2b3Q0VF55 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.1 ms