Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rundc1Q0VDN7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rundc1Q0VDN7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms