Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vps8Q0P5W1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms