Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ubxn2bQ0KL01 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms