Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Znf541Q0GGX2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Znf541Q0GGX2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms