Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700061G19RikQ08EE8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700061G19RikQ08EE8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms