Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms