Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Tff1Q08423 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tff1Q08423 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tff1Q08423 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tff1Q08423 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tff1Q08423 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tff1Q08423 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tff1Q08423 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tff1Q08423 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tff1Q08423 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tff1Q08423 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tff1Q08423 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tff1Q08423 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Tff1Q08423 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Tff1Q08423 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Tff1Q08423 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Tff1Q08423 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Tff1Q08423 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Tff1Q08423 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Tff1Q08423 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tff1Q08423 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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