Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgm3Q08189 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms