Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ebf1Q07802 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms