Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms