Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms