Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms