Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms