Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Caprin2Q05A80 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms