Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms